从多数大棚种菜的农户调查来看，效益是比较明显的。但是也有些农民种植大棚菜，效果不尽人意，除了蔬菜品种不对路外，“四害”的制约往往是造成损失的重要因素。所谓“四害”，就是肥害、药害、旱害和连茬障碍。

一、肥害。实际上是积盐的危害，主要原因是偏施化肥或过量施肥使土壤产生盐渍化。发生肥害后产生的问题，一是抑制蔬菜根系发育，削弱了对水、肥吸收的功能；二是土壤溶液浓度过大，蔬菜株体发生反渗透现象，导致生理萎蔫或者叶缘枯焦；三是进发有毒气体危害；四是引发蔬菜缺素症。

二、药害。有显性药害，症状明显。有隐性药害，症状潜伏或者延至下茬蔬菜。产生药害的原因，一是选用农药品种不对路或者误用了除草剂；二是施药浓度过大；三是购用了劣质农药；四是没有避开高温时节施药。发生药害后，有的蔬菜叶片很快失绿；有的产生焦斑、穿孔；有的落叶、落花、落果或者出现畸形；最严重的整株枯萎。

三、旱害。是制约大棚蔬菜发展最为关键的因素之一。发生原因，一是蔬菜大棚选址不当，当地缺乏水源；二是虽有水源，但水质不良；三是水量较足，沟、渠、排灌设施却不配套，有水难引，望水兴叹。旱害既影响蔬菜适时播种安苗，又影响蔬菜正常生长，同时给蔬菜施肥、打药等管理带来极大的困难。旱害的影响有时还超过肥害和药害。